Налоговая опоздала из-за сроков исковой давности

Налоговая инспекция попросила РЖД доплатить 9,1 млрд руб. налогов за 2003-2007 гг., но монополия сократит эту сумму как минимум на 3,36 млрд руб. — истекли сроки исковой давности
О налоговых претензиях к РЖД «Ведомостям» стало известно из отчета Счетной палаты (от 11 декабря 2009 г., есть у «Ведомостей»). Межрегиональная инспекция ФНС (МИФНС) по крупнейшим налогоплательщикам № 6 в 2006-2008 гг. трижды проверяла, как РЖД платила налоги в 2003-2007 гг., сказано в документе. В каждом случае налоговики начислили компании дополнительных налогов и штрафов: 1,9 млрд руб. — за 2003 г., 2,4 млрд руб. — за 2004-2005 гг. и 4,8 млрд руб. — за 2006-2007 гг.
Часть претензий компании удалось отбить. Так, суд признал незаконным доначисление НДС на 1,1 млрд руб. за 2003 г., а также штраф в 224,3 млн руб. Сумму претензий за 2004-2005 гг. суд снизил на 950,5 млн руб. Причина в том, что инспекция пропустила срок давности, отмечают аудиторы. Например, решение по проверке за 2003 г. было вынесено 7 марта 2007 г. А по Налоговому кодексу срок давности составляет три года с момента окончания налогового периода.
Часть суммы по третьей проверке тоже была начислена после истечения сроков давности, выяснила Счетная палата. На момент проверки аудиторов (ноябрь 2009 г.) налоговая еще не вынесла официального решения о доначислении налогов за 2006-2007 гг. (есть только акт проверки). А значит, по претензиям с января по октябрь 2006 г. срок давности истек, делают вывод аудиторы. За это время налоговики насчитали РЖД 1,2 млрд руб. НДС и 239,2 млн руб. штрафа. С учетом этого и решений судов РЖД удастся снизить претензии как минимум на 3,36 млрд руб. Но может быть и больше: компания представила возражения на 90% предъявленной налоговиками суммы за 2006-2007 гг., пишет Счетная палата.
МИФНС № 6 начисляет слишком много налогов, из которых львиная доля оспаривается, отмечает Счетная палата. Так, в 2007–2008 гг. она проиграла в суде 336 дел из 479 рассматривавшихся, а сумма налоговых претензий в результате снизилась с 18,1 млрд руб. до 10,1 млрд руб., указывается в отчете СП. Деловая газета Ведомости